Поведение рептилий в брачный период еще до конца не изучено исследователями. Однако, достоверно известно то, что химические сигналы играют не последнюю роль при общении полов. В период ухаживаний, некоторые пресмыкающиеся способны издавать определенные звуки, а ящерицы, к примеру, в этот период демонстрируют противоположному полу и соперникам свой яркий окрас, выросты на коже и гребни. Такие старания не только помогают самцам спугнуть соперника, но и привлечь самку, и завладеть территорией.

Для ящериц, в большинстве случаев, оплодотворение играет ключевую роль при размножении. Но среди ящериц есть несколько видов, которые размножаются посредством партеногенеза. Такой вид размножения не предусматривает процесс оплодотворения.

Яичники и семенники - органы размножения пресмыкающихся. Они имеют большое сходство с органами размножения земноводных. Однако, рептилии обладают несколько большими яичниками. Это связано с тем, что яйца рептилий большего размера. В целом, яйцевод пресмыкающихся и яйцевод земноводных отличается строением стенок, которые выделяют скорлуповую и белковую оболочки. Все пресмыкающиеся размножаются на суше. Кроме того, такие животные, как крокодилы, черепахи и морские змеи, чей образ жизни, в основном, водный, размножаются также на суше. У рептилий происходит внутреннее оплодотворение. А у некоторых видов, период размножения характеризуется повышением активности: некоторые самцы устраивают драки.

В большинстве случаев, пресмыкающиеся откладывают от 8 до 16 больших яиц за раз. Яйца рептилий покрыты прочной кожистой скорлупой. Чаще всего, рептилии откладывают яйца в трещинах скал, в почве или коре деревьев. Период развития яиц полностью зависит от окружающей температуры. Чаще всего, температура колеблется от 20 до 30 градусов. Критической считается температура в 40 градусов. Потому в пустыне яйца зачастую откладываются в тенистые места или же под землю.

Общее число кладок за год у змей - одна, у некоторых ящериц и черепах доходит до 3-4 или даже больше. Количество яиц рептилий за одну кладку зависит от их размера и возраста особи. Там, где яйца могу съесть другие животные, родители чутко их охраняют. Этот инстинкт хорошо развит у крокодилов и некоторых видов змей. К примеру, питоны высиживают яйца, обвивая их своим телом.

Для пресмыкающихся характерно живорождение или же яйцеживорождение. У живородящих видов яйца проходят этапы развития внутри матери. Там же они получают необходимые для роста и развития вещества через орган, похожий на плаценту. Когда рождается рептилия, она очень напоминает родителей, хотя иногда окрас может существенно отличаться. Для пресмыкающихся не свойственно заботиться о потомстве. Заботу могут проявлять лишь крокодилы и некоторые виды ящериц.